Der Kreisverband Straubing-Bogen deckt flächenmäßig die Stadt Straubing und den Landkreis Straubing-Bogen ab. Übergeordnete Gliederungen sind der Bezirksverband Niederbayern, der Landesverband Bayern und der Bundesverband von BÜNDNIS 90/DIE GRÜNEN.
Der Kreisverband wird von seinem auf zwei Jahre gewählten Vorstand repräsentiert. Der derzeitige Vorstand besteht aus zwei gleichberechtigten Vorsitzenden, einem Kassier, einer Schriftführerin und zwei Beisitzer*innen.
Innerhalb des Kreisverbands gibt es aktive Ortsvereine mit eigener Struktur.
Der Kreisverband hat eine Satzung, die in ihrer jetzigen Form von der Kreisversammlung am 12.11.2025 beschlossen worden ist.